MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 14561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017566	TGA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017566	CCAT	2	8	2676	2683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017566	TAT	2	6	2729	2734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017566	GA	3	6	3866	3871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017566	TGT	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017566	TGT	2	6	6307	6312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017566	TGAT	2	8	6315	6322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017566	ATT	2	6	6362	6367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017566	AGC	2	6	6385	6390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017566	TAT	2	6	6391	6396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017566	GTT	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017566	A	6	6	7594	7599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017566	T	6	6	7616	7621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017566	T	6	6	10705	10710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017566	CTT	2	6	10713	10718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017566	TA	3	6	10736	10741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017566	GA	3	6	11349	11354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017566	A	7	7	11410	11416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017566	TAGG	2	8	14744	14751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017566	TA	3	6	14813	14818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017566	CAT	2	6	15329	15334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017566	TGAT	2	8	15735	15742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017566	AT	3	6	15763	15768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017566	AATT	2	8	15798	15805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017566	TAA	2	6	15829	15834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017566	CCA	2	6	19215	19220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017566	CT	3	6	19243	19248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017566	CAG	2	6	19255	19260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017566	CAT	2	6	19268	19273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017566	TG	3	6	19283	19288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017566	ACA	2	6	19316	19321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017566	ATT	2	6	19498	19503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017566	ATG	2	6	19514	19519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017566	AGC	2	6	19544	19549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017566	TGT	2	6	19594	19599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017566	AGATTA	2	12	19608	19619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017566	ATA	2	6	19638	19643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017566	AAT	2	6	21697	21702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017566	AG	3	6	23726	23731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017566	TCAC	2	8	24061	24068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017566	TTATT	2	10	24077	24086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017566	ATT	2	6	24200	24205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017566	TTA	2	6	24827	24832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017566	AGT	2	6	26298	26303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017566	AGTT	2	8	30547	30554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017566	CTAATG	2	12	30562	30573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017566	AAT	2	6	30601	30606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017566	TTG	2	6	33339	33344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017566	GA	3	6	33360	33365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017566	AGG	2	6	33367	33372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017566	CCT	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017566	T	6	6	33384	33389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017566	GGT	2	6	33444	33449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017566	TG	3	6	34027	34032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017566	AAT	2	6	34121	34126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017566	TTG	2	6	34131	34136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017566	AAT	2	6	34742	34747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017566	ACA	2	6	35691	35696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017566	TAG	2	6	36146	36151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017566	AG	3	6	36163	36168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017566	TA	3	6	37503	37508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017566	ACTA	2	8	37528	37535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017566	GGTCA	2	10	38159	38168	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017566	AAG	2	6	38333	38338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017566	A	6	6	38342	38347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017566	TG	3	6	38478	38483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017566	GTTT	2	8	38585	38592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017566	CTT	2	6	38598	38603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017566	A	6	6	38624	38629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017566	ACA	2	6	38663	38668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017566	GGC	2	6	38712	38717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017566	GCA	2	6	38743	38748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017566	GCG	2	6	38776	38781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017566	AGG	2	6	38871	38876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017566	CGA	2	6	38951	38956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017566	GAT	2	6	38976	38981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017566	GCA	2	6	39025	39030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017566	GT	3	6	39078	39083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017566	GAA	2	6	39084	39089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017566	GGA	2	6	39120	39125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017566	AGA	2	6	39167	39172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017566	CAG	2	6	39193	39198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017566	G	6	6	39340	39345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017566	GGA	2	6	39384	39389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017566	GGC	2	6	39404	39409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017566	GAA	2	6	39647	39652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017566	TGC	2	6	39723	39728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017566	GTC	2	6	39735	39740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017566	TGG	2	6	39813	39818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017566	GGA	2	6	39849	39854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017566	GAC	2	6	39862	39867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017566	TCA	2	6	39874	39879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017566	AC	3	6	39900	39905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017566	TCG	2	6	39967	39972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017566	AC	3	6	40069	40074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017566	AAG	2	6	40105	40110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017566	G	7	7	40128	40134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017566	CAC	2	6	40139	40144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017566	CCT	2	6	40210	40215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017566	CA	3	6	40300	40305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017566	ATG	2	6	40408	40413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017566	A	6	6	40434	40439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017566	TTA	2	6	40480	40485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017566	CTT	2	6	40520	40525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017566	CAA	2	6	40561	40566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017566	GTA	2	6	40651	40656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017566	TCA	2	6	40738	40743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017566	TAG	2	6	40831	40836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017566	GCGA	2	8	40839	40846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017566	G	6	6	40988	40993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017566	TCC	2	6	40998	41003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017566	CTGA	2	8	41018	41025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017566	GGA	2	6	41308	41313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017566	TAC	2	6	41512	41517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017566	CGG	2	6	41530	41535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017566	CGTC	2	8	41543	41550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017566	AAC	2	6	41562	41567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017566	AGC	2	6	41652	41657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017566	CAT	2	6	41658	41663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017566	AAAG	2	8	41666	41673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017566	AGTCG	2	10	41688	41697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017566	ACC	2	6	41730	41735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017566	TGAAGG	2	12	41793	41804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017566	GA	3	6	42005	42010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017566	AGGCT	2	10	42017	42026	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017566	GCG	2	6	42030	42035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017566	GGT	2	6	42054	42059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017566	GGTG	2	8	42061	42068	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017566	TGA	2	6	42104	42109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017566	AGT	2	6	42129	42134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017566	TCT	2	6	42157	42162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017566	GGT	2	6	42203	42208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017566	GA	3	6	42233	42238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017566	TGA	2	6	42302	42307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017566	CT	3	6	42314	42319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017566	ATTG	2	8	42436	42443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017566	CGG	2	6	42484	42489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017566	ATG	2	6	42560	42565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017566	GTC	2	6	42741	42746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017566	ACC	2	6	42755	42760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017566	TGG	2	6	42815	42820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017566	TCC	2	6	42841	42846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017566	GGA	2	6	42858	42863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017566	GGT	2	6	42978	42983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017566	CGG	2	6	43065	43070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_017566	GAT	2	6	43213	43218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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